REAKSI-REAKSI PADA NUKLEOTIDA
Pendahuluan
Nukleotida, setiap anggota kelas
senyawa organik di mana struktur molekul terdiri dari unit (dasar) yang
mengandung nitrogen yang terkait dengan gula dan gugus fosfat. Nukleotida
sangat penting untuk organisme hidup, karena merupakan bahan penyusun
asam
nukleat, zat yang mengontrol semua karakteristik keturunan.
https://www.britannica.com/science/nucleotide
Ikhtisar
• Nukleotida adalah nukleosida terfosforilasi.
• Nukleosida adalah kombinasi dari basa asam nukleat dan gula.
• ATP adalah nukleotida yang berpartisipasi dalam berbagai reaksi
transduksi energi.
• NTP adalah blok pembangun utama dari asam nukleat.
• Polimerase asam nukleat disebut sebagai pols.
• Dalam sel mamalia, ribonukleotida diubah menjadi deoksiribonukleotida
pada tingkat NDP.
• DNA dan RNA secara struktural mirip polimer.
• Monofosfat nukleosida diubah menjadi turunan di- dan trifosfat
masing-masing melalui transfer fosforil dari ATP.
• Nukleotida dapat disintesis dari molekul organik kecil, dan mereka
dikonservasi melalui jalur penyelaman.
Basa organik
Ada empat basa organik yang terlibat dalam pembentukan molekul DNA:
1. adenin dan guanin (kedua purin yang mengandung dua cincin dalam
strukturnya)
2. timin dan sitosin (kedua pirimidin hanya mengandung satu cincin dalam
strukturnya)
Struktur dasar nukleotida ditunjukkan di bawah ini.
struktur dasar nukleotida
Dalam semua molekul nukleotida, ikatan yang menahan gugus fosfat ke gula dan basa ke gula meru
pakan hasil reaksi kondensasi. Air dihilangkan ketika mereka terbentuk. Dalam kedua kasus,
untuk membentuk air berasal dari gugus -OH gula.
Pemutusan Hubungan Internucleotide
Jelas, stabilitas molekul asam nukleat polimerik ditentukan oleh
reaktivitas nodus intukukleotida dalam larutan berair. Hal ini paling penting
untuk eksperimen yang bekerja dengan asam nukleat untuk mengetahui batas
stabilitas hubungan intukleotida pada DNA dan RNA. Untuk tingkat tertentu, ini
ada hubungannya dengan fakta bahwa hasil penelitian biologi sering bergantung
pada integritas struktur primer asli dari molekul asam nukleat biologis aktif:
pembelahan hanya satu dari seribu hubungan internucleotide dapat mengarah pada
kehilangan aktivitas. Dengan demikian, reaksi yang menyebabkan pembelahan
ikatan fosfodiester (internukleotida) menempati posisi khusus di antara mereka
yang melibatkan asam nukleat.
Reaksi di mana rantai polinukleotida mengalami degradasi dapat didasarkan
pada dua mekanisme yang berbeda. Reaksi tipe pertama, dengan pembelahan ikatan
P-O, pada dasarnya substitusi nukleofilik pada atom fosforasi intukleotida
yang, dalam hal ini, menunjukkan sifat elektrofilik.
Reaksi tipe kedua, dengan pembelahan ikatan C-O, terjadi ketika gugus
karbonil muncul dalam fragmen fosfat dinukleosida dari polinukleotida pada
posisi-b terhadap kelompok fosfodiester. Mereka mengambil bentuk b-eliminasi
yang dikatalisasi oleh basis:
Sama seperti dengan pembelahan ikatan P-O, kekuatan motif di belakang
penghapusan-b adalah perilaku elektrofilik fosfor, kapasitas untuk membelah
ikatan C-O yang dalam hal ini ditentukan oleh stabilitas anion yang berangkat.
Akibatnya, jenis pembelahan hubungan internukleotida ini tidak langsung,
tergantung pada beberapa jenis transformasi primer sehingga menimbulkan
karbonil pada posisi-b sehubungan dengan kelompok phosphodiester
internucleotide. Ini adalah mekanisme yang mengatur hidrolisis asam DNA,
hidrolisis RNA depyrimidinated oleh amina primer, serta pelepasan nukleosida
3'-terminal dalam RNA setelah oksidasi periodat.
PERMASALAHAN
1. Pada kondisi seperti apa nukleotida dapat membentuk DNA !
2. Kita ketahui bahwa nuklosida pada sel terdiri dari gugus pospat, gula pentosa, dan basa . mengapa ke setiap basa tersebut berikatan dengan susunan nya, G dan C , A dan T !
3. Mengapa pada proses pembentukan nukleotida dalam sel memerlukan enzim !
4. Hal apakah yang melatarbelakangi bahwa setiap individu memiliki DNA yang sama tetapi berbeda ciri khasnya !
No comments:
Post a Comment